· 阐发经义
蒲辅周是富有经验的临床医学家，又是懂得唯物辩证法的中医理论家 。 他认为，中医学有独特的理论，《内经》、《伤寒论》等典籍，是中医理论体系以辩证法为内核的结晶，必须认真继承和发展 。 他对《内经》和《伤寒论》有精深的研究，在继承《内经》、《伤寒论》的理论基础上，对其中的一些理论问题作了精辟的阐发，体现了他师古而不泥古的风范 。
如对“冬伤于寒，春必病温”和“冬不藏精，春必病温”的经义，摆脱了一般学者从伏气论的观点所作的解释（即冬日受了寒邪，邪气伏藏于体内，到春天发为温病），而是从冬不藏精比类悟出，冬失因藏和冬病伤寒之人，其正气必虚，春天邪气所凑，自然容易感染而得温病，不可能由冬天感受的寒邪，整个冬天伏藏于体内而到春天才发病 。 又如对“阳常有余，阴常不足”的看法，他认为五脏六腑皆有阴阳，何者为阳有余？何者为阴不足？且阴平阳秘，精神乃治，一有偏胜，则必为病，岂可能阳常有余，阴常不足，而人不为病的？所以人体之阳，不是火有余而是水不足，这就是王冰“壮水之主以制阳光，益火之源以消阴翳”的本意 。 但自朱丹溪提出此说后影响医界数百年，直至明代张介宾提出“阳非有余，阴常不足”，才将朱丹溪的影响纠正过来 。 反映了蒲辅周继承前贤学术，博学广思，师古而不泥古的精神 。 对《医林改错》及作者，蒲辅周的评价是：“王清任先生苦心于医药，积有心得，值得学习和尊敬 。 但仅观察数十具不完整的尸体，而确定古人是非，殊属自矜太过，其图证之现代解剖亦有未合……” 。 他对王清任的评价反映了他的一家之言，但也是他学习前人经验并不盲从的一例 。
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对中医治疗大法的汗、吐、下、和、温、清、消、补八法，蒲辅周认为，八法的具体应用应掌握分寸，若当用而不用是为失治，不当用而用是为误治，但也有当用而用之不得其法，结果病情未得改善 。 蒲辅周从《伤寒论》桂枝汤下载“温覆令一时许，遍身??，微似有汗者益佳，不可令如水流漓，病必不除”悟出，八法之应用，应达到汗而勿伤，下而勿损，和而勿泛，吐而勿缓，温而勿燥，寒而勿凝，消而勿伐，补而勿滞的境界 。 比如补法，他认为，补法用于虚证，能补不足，促使患者康复 。 但虚有因虚而病，有因病而虚；有渐虚，有顿虚，还有先天、后天之别；又有阴阳、气血、津液之分；五脏又各有虚证，所以要有多种补剂，针对使用 。 漫补达不到效果，补药堆积也难达到效果，甚至导致胸腹胀满，衄血便燥等不良反应，总结出了“气以通为补，血以和为补”的指导原则 。
· 精通医理
蒲辅周一生临证近70年，积累了丰富的临床经验 。 对于内科疾病，他认为，内科是临床医学的基础 。 他治内科，在遵崇仲景学说同时，并采撷历代各家学派之长，如刘河间之寒凉，张子和之攻下，李东垣之温阳，朱丹溪之滋阴，融众长于一炉，以补仲景之未备，开后学之法门 。 因此他能集思广益，出奇制胜 。 他平素所治内科病例，大多是应邀会诊，故多疑难杂症，要取得显效殊属不易 。 但由于他医理精通，经验丰富和善于辨证论治，每能得心应手 。
【蒲辅周的故事—精研医理，博览兼收，治学严谨，精益求精】蒲辅周治疗外感热病，尤见独到 。 临床所见外感热病，属中医伤寒、温病范畴 。 自明清温病学说形成，即有了伤寒学派与温病学派之论争 。 对于两者的关系，蒲辅周认为，伤寒学说开温病学说之先河，温病学说补伤寒学说之未备，应当互为充实 。 伤寒与温病是始异（伤寒是寒邪侵犯太阳经，温病是温邪首先犯卫），中同（寒邪入里化热，证属阳明，治以白虎、承气，温病顺传气分，治亦以白虎、承气），终异（伤寒传入三阴，治宜温补，温病入营血，灼伤津液，治宜清润） 。 伤寒治以发汗解表，温病治宜透达取汗，两者均需顾及津液 。 这些心得和认识，使他在温病学术上多所建树，特别在指导治流行性乙型脑炎方面更多贡献 。
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